O Museu Paraense Emilio Goeldi, fundado em 1866, é o mais antigo museu da Amazônia e o segundo mais antigo do Brasil, além de ser uma instituição de pesquisa vinculada ao Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações. Suas atividades concentram-se no estudo científico dos sistemas naturais e socioculturais da Amazônia, bem como na divulgação de conhecimentos e acervos relacionados à região. É reconhecido mundialmente como uma das importantes instituições de investigação científica sobre a Amazônia brasileira.
O Museu Nacional dos Povos Indígenas é uma instituição de preservação e promoção do patrimônio cultural indígena ligada à Fundação Nacional dos Povos Indígenas (Funai) e tem como objetivo divulgar a diversidade contemporânea e histórica dos povos indígenas do país. Possui um dos maiores acervos etnográficos do país, além de ser a instituição depositária de importantes arquivos que relatam a ação do Estado brasileiro junto aos povos indígenas. Tornou-se referência na qualificação e gestão de acervos, através da participação e formação de pesquisadores indígenas pelo Programa de Documentação de Línguas e Culturas Indígenas – ProgDoc.
